Gestion des fichiers :

• La base de données contient 3 fichiers principaux :
• Les familles - 9 enregistrements
• Les genres - 685 enregistrements
• Les espèces - 18000 enregistrements environ
• Chaque espèce fait partie d'un genre, qui lui-même fait partie d'une famille.
• Les enregistrements sont identifiés par un code unique de 4 lettres.
• La base contient également 272 images scannerisées

Pour chaque espèce, le programme mémorise de nombreuses rubriques : nom en clair, références, synonymies, famille, genre, valeurs indicielles spécifiques.

Le programme affiche également les caractéristiques autécologiques pH, salinité, degré de trophie etc..avec cumul des abondances pour chaque rubrique (compilations Van Dam et al. 1994, Lange Bertalot 1979, Hofmann 1994, Håkansson 1993, Denys 1991)

Possibilité également d'enrichir la base d' images scannerisées.

Les fichiers peuvent être listés sous différentes présentations et différents critères.

Toutes les rubriques d'une espèce (y compris l'image) peuvent également être imprimées.

On peut également visualiser le tableau des espèces retenues pour le calcul de l'IBD avec leur probabilité de présence pour les 7 classes de qualité de l'eau. Le profil fréquentiel de chacune de ces espèces peut être représentée graphiquement.

Gestion des inventaires

Dans Omnidia, le nombre d'inventaires comme le nombre des espèces par relevés ne sont pas limités.

26 rubriques donnent le détail et les particularités des inventaires :

N° d'analyse, n° de préparation (index UNIQUE), date, noms des bassins, rivière, site ; Code hydrologique, PK ( point kilométrique), température, code prélèvement (voir les correspondances de ces codes dans l'écran d'aide ou par le menu principal ) et enfin particularités (zone de texte libre)

Les rubriques liées au comptage sont : nombre d'espèces, effectif, diversité, équitabilité.

A la fin de chaque comptage, le programme affiche les totaux et les 17 indices diatomiques :

A droite de l'écran est visible la liste des espèces présentes.

Le graphique correspondant à l'indice IBD s'obtient en cliquant sur "graphe IBD".

Les caractéristiques autécologiques (pH, salinité, degré de trophie etc..) sont calculées par Omnidia pour chaque inventaire.

Cliquer sur "Autécologie" ouvre 3 fenêtres successives :

Sur la première, les valeurs de VanDam (1994), Lange-Bertalot (1978) et Hofmann. (1994)

Sur la deuxième, les valeurs de Denys (1991) et Hakansson (1993) et les indices pH de Renberg &Hellberg (1982) et Eloranta (1990).

Sur la troisième, les valeurs de l'Indice diatomique saprobie/eutrophisation IDSE (Louis Leclercq, 2008)

Des écrans d'aides sont accessibles à tout moment (menu aide) et indiquent la méthode de calcul des différents indices.

Il est possible :

• de dupliquer l'ensemble d'une préparation, afin de faire des simulations.
• de supprimer des préparations , soit individuellement, soit par lot entre 2 numéros.
• de sommer 2 préparations : indiquer les numéros.
• d'exporter ou d'importer un lot de préparations sous forme de fichier texte
• de rechercher une espèce dans une sélection d'inventaires
• de remplacer les noms des taxons par leurs nouvelles dénominations (dans une sélection d'inventaires)

Recherches et Editions :

Chaque préparation peut être imprimée individuellement : le détail des espèces est listé avec les noms en clair et leur abondance relative dans l'ordre décroissant des pourcentages

Une sélection peut être faite parmi toutes les préparations grâce à une recherche multi-critères : Date, lieu, température… et également sur les % d'abondance de 4 espèces.

Plusieurs types d'éditions sont alors proposés :

• une liste simple avec les codes des espèces et leur %
• une liste détaillée : codes, noms en clair, % d'abondance, indices et totaux
• une liste avec les valeurs écologiques
• tableaux : les espèces sont en lignes et les préparations en colonnes. Les noms sont en clair classés par ordre alphabétique et les totaux sont effectués pour chaque colonne
• Les indices de chaque préparation sont également imprimés à la fin du tableau.
• Possibilité de visualiser le graphe de 3 indices (IPS, CEE, IBD ) pour les préparations sélectionnées
• Possibilité d'exporter vers Excel ces tableaux

CONCLUSION :

• Omnidia est un programme très facile à utiliser grace à sa grande convivialité.
• Le nombre d'enregistrements est illimité pour chaque fichier ( y compris le nombre d'espèces dans un comptage)
• Chacun peut enrichir la base de données livrée avec le programme.

CARACTERISTIQUES :

Le programme fonctionne sur PC Windows XP - VISTA - 7 - 8 (32 ou 64 bits)

Il peut échanger des données avec Excel.

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E-mail : cath.lecointe@gmail.com

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